發現2D看不到的低豐度蛋白! 開創蛋白質組學研究的新時代
隨著蛋白質組學研究開展的越來越廣泛及深入,傳統的研究手段遇到了很大的挑戰。一些比較容易發現和研究的高豐度蛋白質被大量報道,而低豐度蛋白質則很難被分離和富集,造成研究的困難。
現在,一種全新的研究技術可以通過在液相狀態下按等電點分離粗樣品,富集低豐度蛋白質,再結合微pH膠條實現3D研究。
研究低豐度蛋白的最有力工具
1D
低豐度蛋白富集儀
MicroRotofor 微型電泳槽是一種制備型等電聚焦(IEF)儀,它可以將溶液中的復雜蛋白樣品按等電點不同分開。無論是單獨使用還是做為完整蛋白純化流程的一部分,MicroRotofor微型電泳槽都可以簡單、快速、有效地將蛋白從復雜的蛋白混和物中分離和富集出來。使用MicroRotofor 微型電泳槽,等電聚焦(IEF)是在可自由流動的溶液中進行的。因此,每一個組分都可以非常容易地收集得到,甚至可將某些組分再進行分離。液相IEF對于分離那些在凝膠IEF介質中易于沉淀或分離不好的蛋白更有效。而且,在溶液中進行IEF能夠讓蛋白保持其天然等電點(pI)。最后,因為IEF的pH梯度是通過載體兩性電解質產生的,所以用戶可以隨心所欲地造成任意連續的pH梯度,從而真正通過pI值篩選蛋白樣品。
特點 | 優勢 |
設計 |
小量蛋白溶液體積 | - 容許研究者分析非常有限的蛋白樣品
- 可以自主優化分離流程
- 與其他蛋白分離溶液兼容 (例如 Aurum 血清蛋白小型試劑盒, ReadyPrep 雙向電泳凈化試劑盒)
- 使用Rotofor 和小型 Rotofor電泳槽分離的組分可以用來再次分離
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易于安裝 | |
10個組分(200–250 μl/組分) | - 完全、徹底地從樣品中篩選蛋白
- 富集特定蛋白濃度可達10倍
- 如果只需較少組分,可將組分合并
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內置Peltier半導體冷卻: (2 檔:-20°C或-10°C) | - 聚焦時保持恒溫將提高重復性
- 防止蛋白質水解和胺甲?;?
- 可實現蛋白質天然狀態下分離 (保持蛋白的天然構向和功能)
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緊湊的外形 | |
技術 |
液體分離介質 | - 可分離在其它介質中難溶的蛋白 (例如疏水蛋白、膜蛋白、大分子量蛋白等)
- 易于配合其它的分離方案
- 可實現蛋白質天然狀態下分離
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膜核心 | - 在收集蛋白時可防止組分間液體相互流動,從而使組分更穩定
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連續pH梯度/建立特定pH值 | - 可通過等電點篩選蛋白
- 可分辨異構體
- 靈活性 — 可根據不同pH梯度
- 可與窄范圍和微小范圍的IPG膠條的結果相匹配
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真空收集 | |
一次性使用的分離腔 | |
可旋轉腔體 | |
? 在蛋白組學研究中,經典的雙向凝膠電泳法(2-DE)對堿性蛋白及低豐度蛋白的分離存在技術障礙,但預分離技術的應用可彌補其缺陷。液相等電聚焦可有效地分離富集復雜蛋白樣品。堿性膠條用于2-DE可極大地提高蛋白上樣量和凝膠分辨率。將上述兩種技術相結合用于堿性蛋白質和低豐度蛋白質的分離鑒定,可使堿端區域雙向凝膠圖譜質量顯著提高,蛋白點更清晰且點數增多,質譜鑒定確信度提高,堿性蛋白和低豐度蛋白質譜鑒定成功率提高,對于蛋白組學研究具有一定的意義。
—— 楊芃原,中國人類蛋白質組組織(CHINA-HUPO)副理事長
相關鏈接:
液相等電聚焦大顯神威:
http://www.biosou.com/index_newshow.php?newsid=13257
用液相等電聚焦電泳純化藻藍蛋白亞基:
http://www.cnki.com.cn/Article/CJFD2006-GDXH200606015.htm
液相等電聚焦結合雙向凝膠電泳分離堿性蛋白:
http://www.ilib.cn/A-gdxxhxxb200610009.html
人胃癌組織中分子伴侶蛋白的表達及檢測:
http://www.wjgnet.com/1009-3079/13/1809.asp
2D
固相干膠條等電聚焦系統
PROTEAN® IEF等電聚焦儀
PROTEAN等電聚焦電泳儀可同時滿足高通量實驗室或普通用戶的需要。它是IEF實驗用的專用設備,具有以下特點:
? 高通量電泳平臺,可容納多達24根7cm膠條或12根11cm、17cm、18cm 和 24 cm 膠條
? 半導體冷卻平臺 ( Peltier-effect ) 精確溫控,保證可重復的聚焦結果和更大范圍的工作溫度 ( 10-25℃ )
? 內置10,000V高壓, 2.4mA電流的電源,當達到最高電壓時,可更快地達到等電 聚焦所要求的理想伏特小時
? 一次性水化/平衡盤簡化了水化膠條轉移到聚焦盤的過程,保證殘余的樣品緩沖液不會通過膠條干擾電流而影響結果
? 有多種聚焦盤和水化/平衡盤可供方便選擇;每個盤均能裝載1-12根膠條。作為自動化的操作方法可直接在聚焦盤進行水化和等電聚焦過程。為提高實驗效率,也可在水化/平衡盤水化膠條的同時,在聚焦盤里聚焦另一組膠條
? 提供預設程序和實時編輯多種方式,最大程度地滿足用戶的不同需要?;谖谋镜挠脩艚缑?,可極簡便的編輯程序并允許用戶對運行程序進行不斷更新
? 可選配熱敏打印機,永久記錄程序和所運行的數據,運行的數據可通過RS-232 串口傳送至電腦中
3D
垂直電泳分離系統
微型PROTEAN Cell系統——世界上最受普遍歡迎的、最方便使用的電泳槽
1. 嵌條天然固定在玻璃板上,省卻了分離式嵌條時代的麻煩,且避免了不同厚度的擔憂;
2. 平行式和推抐式的組裝易如反掌。
3. 兼容預制膠和手灌膠。
4. 玻板、樣品梳上均有厚度、孔數的標記,易于識別。
5. 專利的加樣導向幫助,不必猜測加樣孔的位置。
6. 塑料樣品梳不會影響聚合過程,并有防氣泡設計。
7. 用轉移組件做Western Blotting時,只需1個小時,且所耗緩沖液極少,有內置的冷卻器。
PROTEAN II Xi和新型XL垂直板電泳槽
1. 適用于一系列電泳,如SDS-PAGE,雙向電泳的一向和二向,Native電泳,制備電泳,梯度電泳及高分辨率核酸瓊脂糖電泳。
2. 可同時運行四塊膠,多種膠長度選擇。
3. 內置冷卻芯,可接冷卻水,冷卻循環池或裝入冷卻劑,即可消除微笑現象。